Indonesia merupakan bagian dari segitiga terumbu karang dunia (coral triangle). Perairan Nusantara juga menjadi pusat keanekaragaman hayati laut yang sangat tinggi. Beberapa catatan memaparkan keanekaragaman hayati pada ekosistem terumbu karang lebih tinggi dibanding hutan hujan tropis.  

Pentingnya ekosistem terumbu karang mendorong berbagai upaya menjaga kelestarian karang, khususnya di daerah prioritas. Pada 1998, pemerintah membentuk pr