Setelah putus kerja sama dengan grup Garuda Indonesia, Sriwijaya Air menghadapi sejumlah masalah. Maskapai ini mesti mengembalikan uang tiket penumpang serta beroperasi hanya dengan hanya sepertiga armadanya. Mereka juga harus mencari dana untuk perawatan pesawat, sedikitnya Rp 42,5 miliar per bulan.