Kehidupan keagamaan di Indonesia setelah era Soeharto telah ditandai dengan munculnya radikalisme keagamaan ekstrem. Konflik antara muslim dan Kristen di Poso, di Provinsi Sulawesi Tenggara, dan di Provinsi Maluku menjadi contoh fenomena ini, seperti halnya peristiwa bom Bali 2002 dan 2005. Munculnya organisasi-organisasi radikal, seperti Front Pembela Islam, Laskar Jihad, da