Andrew Z. Fire lahir di Santa Clara County, California, Amerika Serikat, pada 1959. Sebenarnya Fire memilih jurusan matematika di University of California, Berkeley. Cukup tiga tahun baginya untuk meraih titel sarjana, tapi dia berpindah haluan untuk lebih menekuni ilmu hayati dan menjadikan genetika sebagai kehidupannya.

Pada usia 19 tahun, dia bergabung dengan Massachusetts Institute of Technology (MIT) di Cambridge, Massachusetts, untuk bekerj